针对x射线脉冲星弱信号埋没在强噪声中，在短时间内周期叠加的脉冲轮廓的信噪比低，影响脉冲到达时间的估计精度和效率，提出基于Daubechies，J啵的x射线脉冲星信号降噪的算法。在对RxrI’E观测数据预降噪处理和周期叠加的基础上，采用Daubechies小波算法做降噪处理，使得较短的时间内仍能获得高信噪比的脉冲轮廓。利用RxTE观测数据进行验证仿真，结果表明，该算法能有效滤除x射线脉冲星信号所包含的设备及空间环境的噪声，在保证脉冲到达时间精度的情况下，缩短了观测时间，提高x射线脉冲星导航的效率。